1999（平成11）年4月より内科定点、15医療機関が加わり、計38の定点となり12シーズン目となった。2011年のインフルエンザの報告数は8,699件 （定点当り228.9）と2001年以降で第4位であり、今年度の数を2001（平成13）年〜2010（平成22）年の10年間の年間平均患者数で除した流行指数は 1.28であった。新型インフルエンザで特大の流行がみられた2009年を除く平年としては大規模な流行になる。
　県全体では1月から3月まで同規模の流行が続き、4月より急速に衰退した。東部と中部は2峰性の波があり（それぞれ3週[28.5]と11週[19.2]、 4週[22.9]と11週[30.7]にピーク）、西部は4週[20.5]がピークであった。報告件数は中部で多く、3,529件（流行指数1.61、定点当り294.1）であり、 東部（隠岐を含む）は2,877件（東部のみ同1.27、225.5）、西部は2,293件（同0.97、176.3）であった。
　年齢別では、乳児2.2％、1〜4歳23.0％、5〜9歳31.5％、10歳代20.6％、20〜50歳代20.0％、60歳以上2.7％であり、10歳未満が56.7％を占めた。

　2011年のインフルエンザも含めた総患者数は29,513件であり、ここ11年では新型インフルエンザが流行した2009年の34,472件に次ぐ第2位に多く、 流行指数も1.32であった。

―患者報告数が特に多かった疾患―　（　）内の数値は流行指数。
手足口病 ：3,659件（4.16）。全県で平成元年以降でも特大の流行があり、発疹も大きく、四肢や体幹に広がり、特徴的な症状であった。
伝染性紅斑 ：778件（3.09）。2006（平成18）年（936件）以来の流行年になった。全県で流行したが、特に中部で多く56％を占めた。
流行性耳下腺炎 ：1,262件（1.33）。東部の特大の流行は縮小したが、東、中、西部でほぼ同規模に発生し、2年連続の流行年となった。
A群溶連菌咽頭炎 ：1,298件（1.24）。ここ6年では5位とやや少なかった。
咽頭結膜熱 ：544件（1.23）。2007年の大流行後は同規模の報告数が続いている。
感染性胃腸炎 ：9,527件（1.16）。ここ6年間では5位の報告数であった。
水痘 ：1,591件（0.88）。ここ11年では毎年1,582〜2,215件の報告があり、変動は小さい。本年はその中で10位とやや少なかった。
突発性発しん ：781件（0.92）。「流行」とする疾患ではない。2001年からは703〜1,093件と変動幅は小さく、本年はここ11年で8位の件数であった。
ヘルパンギ―ナ ：524件（0.67）。ここ11年では年間372〜1,105件の報告があり、2001年、2003年、2007年が流行と言える。本年は10位であった。
百日咳 ：9件（0.90）。ここ11年では2004年31件、2005年12件、2,008年19件の他は一桁の件数である。

RSウイルス感染症 ：2010/2011年シーズン（7月〜6月）は417件（東部174件、中部149件、西部94件）。2004/2005年シーズン以降は32件、149件、250件、238件、 346件と続き、2009/2010年シーズンは488件であった。47週（11月下旬）に10件を超え（23件）、ピークは51週と52週の46件と48件であった。 7週（2月中旬）に10件未満になった。

東部（隠岐を含む） ：手足口病（4.17）、伝染性紅斑（2.00）、咽頭結膜熱（1.62）
中部 ：伝染性紅斑（5.23）、手足口病（4.32）、流行性耳下腺炎（1.44）
西部 ：手足口病　（3.97）、伝染性紅斑（2.07）、流行性耳下腺炎（1.37）
　なお、百日咳は全県の9件中6件が中部から報告された。
咽頭結膜熱 ：松江圏域（44.9）、出雲圏域（28.6）、益田圏域（19.3）で多かった。
A群溶連菌咽頭炎 ：中部（100.0）、東部（64.9）、隠岐（49.0）で多かった。隠岐は2010年の大流行よりかなり減った。
感染性胃腸炎 ：松江圏域（608.6）、大田圏域（579.0）、出雲圏域（394.0）で多かったが、いずれも2010年より減少した。
水痘 ：松江圏域（88.3）、中部（83.6）、益田圏域（61.0）で多かったが、いずれも2010年より少なくなった。
手足口病 ：全圏域で多かったが、特に益田圏域（203.7）、松江圏域（201.6）、出雲圏域（188.6）で顕著であった。
伝染性紅斑 ：4年間の非流行年の後、全圏域で流行した。出雲圏域（71.4）、雲南圏域（40.5)、松江圏域（30.7）と、中部以東で多かった。
ヘルパンギーナ ：2010年と同様に松江圏域(49.0)のみで多かったが、特に大きい流行ではなかった。
流行性耳下腺炎 ：大田圏域（167.5）で大流行になった。2009年は益田圏域（60.7）、2010年は松江圏域（167.9）が特に大きい流行圏域であった。

　月別（1か月は4週に換算）にみた県全体の全疾患の患者報告数（インフルエンザを含む）は、1月（4,179件）、2月（3,623件）、3月（3,993件）で特に多く、 この3か月で年間の43.6％を占めた。少なかったのは8月（1,038件）、9月（1,418件）、10月（1,048件）、11月(1,407件)で、この4か月で年間の18.2%を占めた。
咽頭結膜熱 ： 通年性に発生したが初夏に流行があり、4月（129件）、5月（106件）の2か月間で年間の46.5％を占めた。ここ11年では2006年6月（185件）の流行が大きかった。
A群溶連菌咽頭炎 ：2月（203件）と3月（212件）に多く、流行が特に大きかった2007年と2008年のそれぞれのピークの6月（189件）と5月（144件）を凌いだ。 最少は昨年と同様に9月（38件）であり、6月（106件）にも小ピークがあった。
感染性胃腸炎 ：3月（1,121件）、4月（1,132件）、12月（1,233件）で多かった。これまでのピーク、2006年11月（1,597件）、2007年12月（1,492件）、 2008年3月（1,492件）、2010年（1,582件）と比べ少なく、2009年1月（1,205件）と同様であった。
水痘 ：1月（182件）、12月（286件）に多く、例年の5月、6月（120件、127件）のピークは比較的に小さかった（2010年は210件と213件）。 なお、2006/2007年の12月と1月は412件と316件であった。
手足口病 ：4月中旬より５月にかけ漸増し、6月（999件）に急増し、7月（709件）にかけ特に大きな流行になった。8月（236件）に一旦減少した後、9月（620件） にも山ができた。26週[6月下旬、394件]と、36週[9月上旬、243件]がピークであった。最近の流行年の2007年9月（191件）、2010年7月（261件）と比較しても流行の大きさがわかる。
伝染性紅斑 ：1月(33件)から例年より多く、4月（107件）をピークに流行した。その後、10月（35件）まで漸減したが、再び増加に転じ、12月には62件になった。 前者の流行は中部、後者は西部と東部が主体である。
ヘルパンギーナ ：7月（146件）をピークに6〜9月の間流行し、約7割は東部から報告された。なお、大流行の2007年7月のピークは447件あった。
流行性耳下腺炎： 2009年5月頃より益田圏域で流行し出し、2010年は東部で特に大きな流行になった。本年は1月（186件）より12月（37件）まで漸減が続いたが、 西部で4月、5月（68、66件）、隠岐で7月、8月（12、11件）をピークに流行した。

RSウイルス感染症（今年度報告分） ：乳児前半18.6%、乳児後半22.6%、1歳代33.5%、2〜4歳21.0%、5〜9歳3.3%であった。10代6件、成人例2件があった。
突発性発しん ：乳児前半3.8％、乳児後半52.1％、1歳代41.4％、2〜3歳2.9%で、例年より1歳代がやや多かった。

1歳代が最多であった疾患 ：咽頭結膜熱（1歳代の占める割合29.6%）、感染性胃腸炎（22.7%）、水痘（27.8%）、手足口病（35.6%）、ヘルパンギーナ（33.0%）であった。 疾患は昨年と同様で、いずれも7歳未満の児に広く分布している。
その他の年齢が最多であった疾患 ：A群溶連菌咽頭炎（3〜5歳、13.2〜13.7％）、伝染性紅斑（4歳、5歳、各17.1%と16.6％）、流行性耳下腺炎（3歳、4歳、各19.3%と16.4％）。 疾患、割合とも昨年とほぼ同様であった。
成人の水痘 ：2005年21件、2006年24件と近年の増加が危惧されたが、2007年以降7件、9件、11件、7件と続き、2011年も11件に止まった。 大学等への進学の際の予防接種の増加によるのかもしれない。
成人の流行性耳下腺炎 ：非流行年の2008年と2009年は3件ずつであったが、流行年の2010年は14件、本年は27件と多く、流行状況に強く影響される。
百日咳 ：9件の内訳は6か月未満3件、3歳、5歳、7歳、10歳代が各1件、成人は2件であった。近年、成人の罹患が問題になり、全国小児科定点よりの報告では、 成人例の割合は、2007年以降30.9%、36.7%、40.5%、2010年第19週までで56.0%と、年々増加している。

本年の特徴
・手足口病が全県で大流行した。皮疹も大きく、四肢、体幹に広がり、特異であった。
・伝染性紅斑が2006年以来の流行年となり、中部を主体に全県で流行した。
・流行性耳下腺炎が2006年以来の流行年となり、2009年の益田圏域、2010年の東部、本年の大田圏域と主体地域を変えつつ流行を続けた。

急性出血性結膜炎 ：1992(H3)年、全県で113件の報告があった後は、急速に減少の傾向を示し、特に1999(H11)年以降は2001(H13)年の4件を除いては全県で1〜2件の報告に止まり、 報告数0件の年もしばしばみられる状況である。2010(H22)年も西部で1件の報告があったのみであったが、本年も全県で報告数は0件であった。

流行性角結膜炎 ：急性出血性結膜炎とほぼ軌を一にするように1998(H9)頃から急速な報告数減少の傾向が続いている。2010(H22)年には全県で8件の報告であったが、 本年は東部15件、中部0件、西部12件とわずかながら報告数増加を認めている。
　流行性角結膜炎の月別報告状況では、東部で年間を通じて散発的に各月1〜2件の報告であったが、西部で6月3件、7月4件の報告があった影響で、 全県としては6,7月に平たい山を持つ流行ラインとなった。
　流行性角結膜炎はここ10年以上、病像の最盛期に著明な結膜偽膜形成、角膜上皮障害を伴う、結膜炎の緩解期に点状表層角膜炎を発症するなど、 典型的な病像を呈する事が稀となり、病像が比較的マイルドである事が多いなど、確定診断が必ずしも容易でない場合もままあると思われる。 幼小児期、学童期の受診行動の変化をも含めて、流行状況の正確な把握のためには、一考を要するものと考えられる。

細菌性髄膜炎 ：中部からのみ14件。乳児4件、20〜50歳代4件、60歳代2件、70歳以上4件であった。1999年以降、中部からは毎年、報告がある。 東部からは2006年より、西部からは2002年より報告はない。 1999年以降の13年間で計71件になった。年齢別内訳は、乳児21件、1〜4歳10件、5〜9歳3件、10歳代3件、成人34件である。
無菌性髄膜炎 ：中部からのみ27件。2007年の108件の大流行を除くと2001年から6〜41件の報告がある。東部からは2006年より、西部からは2002年より報告はない。 本年の年齢分布は乳児4件、1〜4歳6件、5〜9歳4件、10歳代3件、成人10件であった。
マイコプラズマ肺炎 ：133件。全国的に6月中旬以降、大きな流行が12月初めをピークに拡大したが、島根県では2009年（147件）の雲南圏域を主とする大流行に次ぐ流行で、 やはり6月から増加し、12月（30件）が最も多かった。雲南圏域24件、出雲圏域10件、大田圏域23件、浜田圏域79件であり、他圏域からは報告はなかった。 相当数の報告漏れが懸念される。
本年の年齢分布は5歳未満60件、5〜9歳25件、10歳代28件、20〜50歳代14件、60歳以上6件であった。
クラミジア肺炎 ：中部から4件、西部から2件あり、1999年以降で最多であった。月別では1月1件、8月2件、11月2件が報告された。年齢分布は10歳未満3件、 20〜30歳代2件、70歳以上1件であった。