2001(平成13)年４月より県内の６総合病院で検出された病原菌を検査材料別に報告してもらい、集計を行っている。
　糞便材料の検出数は一年を通じて横ばい状態であるが、検出総数が2005年は増加した。（556件→520件→640件） 咽頭および鼻咽喉材料の検出数も増加した。（図16）
糞便検出病原菌の構成をみると、EPECやETECなどの大腸菌が全体の57%をしめた。Salmonella属は減少傾向にあり （32件→15件→16件）、島根県においてSalmonella属による集団食中毒もみられなかった。（図17）
血液、喀痰・気管吸引液および下気道材料からはStaphlococcus aureus（MRSA）を含むStaphlococcus属の 分離率が高かった。（血液66.0%、喀痰・気管吸引液および下気道47.5%）

調査対象医療機関名
　松江赤十字病院、島根県立中央病院、公立雲南総合病院、浜田医療センター、益田赤十字病院、隠岐広域連合 立隠岐病院

菌種･群･型	2005
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli(EHEC/VTEC)	2	7		2	1	3	8	2	4	4	1	2	36
E.coli(ETEC)	13	11	8	4	1	1	4	5	2	1	1		51
E.coli(EIEC)	1		1					2	1	1			6
E.coli(EPEC)	30	36	25	9	22	17	18	25	28	17	15	15	257
E.coli(その他･不明)				5	10	2	2	1	1	1			22
Salmonella Typhi													0
Salmonella Paratyphi A													0
Salmonella　O4								2					2
Salmonella　O7					2	1	1	1	1		1		7
Salmonella　O8									2				2
Salmonella　O9		1						3					4
Salmonella　O9,46													0
Salmonella　O3,10													0
Salmonella　O1,3,19													0
Salmonella　O13													0
Salmonella　O18													0
Salmonella　上記以外の群													0
Salmonella　群不明									1				1
Listeria monocytogenes													0
Yersinia entercolitica													0
Yersinia pseudotuberclosis													0
V.choleraeO1:Eltor, Ogawa,CT(+)													0
V.choleraeO1:Eltor, Ogawa,CT(-)													0
V.choleraeO1:Eltor, Inaba,CT(+)													0
V.choleraeO1:Eltor, Inaba,CT(-)													0
V.choleraeO139,CT(+)													0
V.choleraeO139,CT(-)													0
V.choleraeO1&O139以外													0
Vibrio parahaemolyticus						1			1				2
Vibrio fluvialis							1						1
Vibrio mimicus													0
Aeromonas hydrophila						1	1		1	1			4
Aeromonas sobria													0
Aeromonas hydrophila/sobria種別せず													0
Plesiomonas shigelloides													0
Campylobacter jejuni	2	1	1		2	1	3	1					11
Campylobacter coli			1			2							3
Campylobacter jejuni/coli種別せず	2	1	1	1	1	1	7	8	2	3	3		30
Sta.aureus(MRSA)	12	25	14	18	16	10	15	14	16	6	8	8	162
Sta.aureus(MRSA以外)	3	4	3	1	6	5	4	1	2	2	2	5	38
Clostridium perfringens													0
Clostridium botulinum E													0
Clostridium botulinum E以外													0
Bacillus cereus												1	1
Shigella dysenteriae													0
Shigella flexneri													0
Shigella boydii													0
Shigella sonni													0
Shigella 群不明													0
Entamoeba histolytica													0
Cryptosporidium													0
Giardia lamblia													0
合計	65	86	54	40	61	45	64	65	62	36	31	31	640

菌種･群･型	2005年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli		3		3	3	4	7	5	4	5			34
Klebsiella pneumoniae	1	2		2	1	1	2	2		1	1	1	14
Haemophilus influenzae					1								1
Neisseria meningitidis													0
Pseudomonas areuginosa	1		2	2		3		1	5	3	2		19
Mycobacterium spp.													0
Sta.aureus(MRSA)	1	4	7	6	5	3	5	7	5	5	1	4	53
Sta.aureus(MRSA以外)	5	1	3	2	1			3	4	2	4	2	27
Sta.(コアグラーゼ陰性）	2	7	1	2	2	1	7	7	5	3	4	1	42
PRSP/PISP	1											1	2
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)													0
Anaerobes	2	4	4	4	2		5	3	3	1	6	1	35
Mycoplasma pneumoniae													0
合計	13	21	17	21	15	12	26	28	26	20	18	10	227

菌種･群･型	2005年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli													0
Haemophilus influenzae								1		1			2
Neisseria meningitidis													0
Listeria monocytogenes													0
Sta.aureus(MRSA)													0
Sta.aureus(MRSA以外)													0
Streptococcus B													0
PRSP/PISP				1						1		1	3
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)		1	2								1		4
合計	0	1	2	1	0	0	0	1	0	2	1	1	9

菌種･群･型	2005年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli	3	4	3	1	5		10	4	4	5	2	5	46
Salmonella Typhi			2										2
Salmonella Paratyphi A													0
Salmonella spp.			7						1				8
Haemophilus influenzae			4					1					5
Neisseria meningitidis													0
Listeria monocytogenes													0
Pseudomonas areuginosa	1	2		1		1	1	6	4		2	2	20
Sta.aureus(MRSA)	9	3	5	3	9	15	3	5	9	8	5	3	77
Sta.aureus(MRSA以外)	3	4	3		2		3	3		4	6	4	32
Sta.(コアグラーゼ陰性）	7	4	10	3	6	12	14	8	9	11	16	16	116
Streptococcus B									3	1			4
PRSP/PISP			1	2	1	1		1				1	7
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)			3		2	2				2	3		12
Anaerobes			1	1			2	1		2	3	2	12
Plasmodium spp.													0
合計	23	17	39	11	25	31	33	29	30	33	37	33	341

菌種･群･型	2005年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
Bordetella pertussis		24											24
Haemophilus influenzae	122	94	117	131	112	99	88	84	79	82	94	100	1202
Neisseria meningitidis		9		1									10
Streptococcus A	18	71	20	24	32	29	12	15	17	5	9	11	263
PRSP/PISP	34	15	38	34	36	35	26	22	15	24	20	21	320
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	23	5	16	25	32	25	23	14	11	22	20	25	241
Corynebacterium diphtheriae													0
合計	197	218	191	215	212	188	149	135	122	133	143	157	2060

菌種･群･型	2005年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
Mycobacterium tuberculosis		1	3		4	5	2	3	1	5	2	1	27
Mycobacterium avium-intracellulare complex	1	1		1		1			1	2		3	10
Klebsiella pneumoniae	32	33	34	22	33	19	49	37	33	48	42	44	426
Haemophilus influenzae	26	22	32	29	27	29	22	19	11	24	27	25	293
Legionella pneumophila													0
Pseudomonas areuginosa	63	43	30	29	47	64	56	62	78	63	52	47	634
Sta.aureus(MRSA)	112	112	103	114	107	114	97	115	94	99	108	112	1287
Sta.aureus(MRSA以外)	30	37	31	33	33	36	40	24	37	32	34	36	403
Streptococcus A	1	5		2	2					8	3		21
Streptococcus B	14	13	12	17	13	19	16	16	21	8	14	14	177
PRSP/PISP	12	12	10	10	11	7	4	6	5	9	12	9	107
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	13	13	24	13	11	10	11	5	10	8	11	6	135
Anaerobes	3	6	3	1	5	1	4	5	1	3	2	4	38
Mycoplasma pneumoniae													0
合計	307	298	282	271	293	305	301	292	292	309	307	301	3558

菌種･群･型	2005年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli	87	59	75	76	59	68	70	69	66	68	42	77	816
Enterobacter spp.	4	4	3	7	4	7	8	12	10	8	12	3	82
Klebsiella pneumoniae	11	8	13	18	5	18	21	14	21	30	14	14	187
Acinetobacter spp.	3	1	2			1	4	4	1	5	4	2	27
Pseudomonas areuginosa	30	31	31	23	41	36	19	36	32	32	42	36	389
Sta.aureus(MRSA)	15	18	15	25	11	14	19	14	12	13	17	15	188
Sta.aureus(MRSA以外)		11	5	8	3	2	4	4	5	1	4	2	49
Sta.(コアグラーゼ陰性）	15	20	24	31	11	21	21	20	13	21	21	16	234
Enterococcus spp.	42	40	43	49	37	52	63	51	42	44	53	58	574
Candida albicans	12	11	15	10	14	13	6	11	12	16	11	22	153
合計	219	203	226	247	185	232	235	235	214	238	220	245	2699

菌種･群･型	2005年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
Neisseria gonorrhoeae			1		1		4	1	1	1	2		11
Streptococcus B	9	15	16	17	9	20	17	17	18	23	8	24	193
Chlamydia trachomatis	4	2	1	1	1	1	2	3	8	5	2	1	31
Ureaplasma													0
Candida albicans	24	29	29	23	16	43	40	42	22	27	20	41	356
Trichomonas vaginalis													0
合計	37	46	47	41	27	64	63	63	49	56	32	66	591