1.感染症発生動向調査の細菌検査
2.集団食中毒や感染症事例の微生物検査
3.病原細菌の型別
4.県内流通食品の細菌検査

5.薬剤耐性菌の細菌検査

1.感染症発生動向調査の病原ウイルス検査
2.食中毒（様）集団発生事例のウイルス検査
3.感染症流行予測調査
4.麻しん及び風しんウイルス検査
5.ダニ媒介感染症の病原検査
6.蚊媒介感染症のウイルス検査
7.新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)のゲノム解析

1.大気汚染環境監視調査
2.有害大気汚染物質モニタリング調査
3.国設酸性雨測定所（隠岐）管理運営
4.微小粒子状物質(PM2.5)の成分分析
5.酸性雨影響調査
6.航空機騒音調査

1.宍道湖・中海の水質監視調査
2.宍道湖・中海の湖内微生物に関する調査

3.松江、雲南、出雲、隠岐地域の水質検査
・河川、湖沼、地下水等の公共用水域、事業場排水等
4.県下全域を対象とする水質検査
・窒素、リン、重金属類、揮発性有機化合物、内分泌攪乱化学物質、その他
5.水質事故等の緊急時対応水質検査