2001(平成13)年４月より県内の６総合病院で検出された病原菌を検査材料別に報告してもらい、集計 を行っている。
　糞便材料の検出数は一年を通じて横ばい状態であるが、検出総数はここ数年減少傾向にある。（622件→556件 →520件）咽頭および鼻咽喉材料の検出数も例年より少なかった（図16）。
糞便検出病原菌の構成をみると、EPECやETECなどの大腸菌が全体の62%をしめた。Salmonella属は減少し （51件→32件→15件）、島根県においてSalmonella属による集団食中毒もみられなかった。（図17）
血液、喀痰・気管吸引液および下気道材料からはStaphlococcus aureus（MRSA）を含むStaphlococcus 属 の分離率が高かった。（血液70.0%、喀痰・気管吸引液および下気道46.3%）

調査対象医療機関名
　松江赤十字病院、島根県立中央病院、公立雲南総合病院、浜田医療センター、益田赤十字病院、隠岐広域連合立隠岐病院

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
E.coli(EHEC/VTEC)							1				1		2
E.coli(ETEC)		3	1	7	8	2	6	3	13	6	3	12	64
E.coli(EIEC)		1						1					2
E.coli(EPEC)	34	29	24	28	17	23	21	7	22	16	15	17	253
E.coli(その他･不明)													0
Salmonella Typhi													0
Salmonella Paratyphi A													0
Salmonella　O4	1							2	1	1		1	6
Salmonella　O7							2					1	3
Salmonella　O8								1					1
Salmonella　O9				1				1	1		2		5
Salmonella　O9,46													0
Salmonella　O3,10													0
Salmonella　O1,3,19													0
Salmonella　O13													0
Salmonella　O18													0
Salmonella　上記以外の群													0
Salmonella　群不明													0
Listeria monocytogenes													0
Yersinia entercolitica						1		1					2
Yersinia pseudotuberclosis													0
V.choleraeO1:Eltor, Ogawa,CT(+)													0
V.choleraeO1:Eltor, Ogawa,CT(-)													0
V.choleraeO1:Eltor, Inaba,CT(+)													0
V.choleraeO1:Eltor, Inaba,CT(-)													0
V.choleraeO139,CT(+)													0
V.choleraeO139,CT(-)													0
V.choleraeO1&O139以外													0
Vibrio parahaemolyticus								5	2				7
Vibrio fluvialis													0
Vibrio mimicus													0
Aeromonas hydrophila					1	1				1		2	5
Aeromonas sobria								1					1
Aeromonas hydrophila/sobria種別せず													0
Plesiomonas shigelloides													0
Campylobacter jejuni			1		1	3	1					2	8
Campylobacter coli													0
Campylobacter jejuni/coli種別せず	1		3	5	2	4	4	2	3		2	2	28
Sta.aureus(MRSA)	6	13	14	14	12	3	7	8	5	8	10	8	108
Sta.aureus(MRSA以外)	1	3	3		1	2	3	1	2	2	3	1	22
Clostridium perfringens													0
Clostridium botulinum E													0
Clostridium botulinum E以外													0
Bacillus cereus							1			1			2
Shigella dysenteriae													0
Shigella flexneri										1			1
Shigella boydii													0
Shigella sonni													0
Shigella 群不明													0
Entamoeba histolytica													0
Cryptosporidium													0
Giardia lamblia													0
合計	43	49	46	55	42	39	46	33	49	36	36	46	520

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
E.coli	2		5		3		3	2	7	2	4	4	32
Klebsiella pneumoniae	4	4	1	1	1	1	2	1		3	1		19
Haemophilus influenzae										1			1
Neisseria meningitidis													0
Pseudomonas areuginosa	3	2	5	5	6	2	1	1	1	1	4	2	33
Mycobacterium spp.													0
Sta.aureus(MRSA)	5	6	6	1	6	7	6	2	1	13	12	5	70
Sta.aureus(MRSA以外)	4	3	3	7	2	1	5	1	4	5	4	7	46
Sta.(コアグラーゼ陰性）	1		3	3	2	4	4	3	1		5	1	27
PRSP/PISP												1	1
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	1			1					1	1	1		5
Anaerobes	7	2	1	2	1	5	4	5	2	5		1	35
Mycoplasma pneumoniae													0
合計	27	17	24	20	21	20	25	15	17	31	31	21	269

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
E.coli		1			1		1						3
Haemophilus influenzae					1					2		1	4
Neisseria meningitidis													0
Listeria monocytogenes												1	1
Sta.aureus(MRSA)													0
Sta.aureus(MRSA以外)													0
Streptococcus B						2							2
PRSP/PISP													0
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)												1	1
合計	0	1	0	0	2	2	1	0	0	2	0	3	11

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
E.coli	5	2	7	4	4	2	5	5	3	6	2	4	49
Salmonella Typhi													0
Salmonella Paratyphi A									1				1
Salmonella spp.													0
Haemophilus influenzae		1			1	1			1	1			5
Neisseria meningitidis													0
Listeria monocytogenes												1	1
Pseudomonas areuginosa		1		1	1	1	2	2	1	2	1		12
Sta.aureus(MRSA)	5	7	3	3	7	11	5	4	7	1	2	6	61
Sta.aureus(MRSA以外)	3	3	5	1	4	4	3	5	1	4	2	1	36
Sta.(コアグラーゼ陰性）	9	11	3	7	6	6	4	13	20	10	8	11	108
Streptococcus B	1					1		1	2		1	1	7
PRSP/PISP		1			1								2
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)				1	2	1							4
Anaerobes						1			2	1	1		5
Plasmodium spp.													0
合計	23	26	18	17	26	28	19	30	38	25	17	24	291

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
Bordetella pertussis													0
Haemophilus influenzae	101	107	116	146	103	128	73	33	55	61	58	97	1078
Neisseria meningitidis													0
Streptococcus A	15	16	14	7	20	18	14	7	12	12	11	23	169
PRSP/PISP	44	46	41	45	39	53	13	22	11	21	41	36	412
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	28	28	24	31	25	20	15	12	23	18	31	18	273
Corynebacterium diphtheriae													0
合計	188	197	195	229	187	219	115	74	101	112	141	174	1932

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
Mycobacterium tuberculosis	2	3		3		1	2		3	1	2	1	18
Mycobacterium avium-intracellulare complex	1	2	3	2	3	1	2	3	2	2	1	1	23
Klebsiella pneumoniae	25	27	31	38	30	44	51	37	27	40	50	31	431
Haemophilus influenzae	14	20	36	17	8	25	18	17	11	26	26	28	246
Legionella pneumophila													0
Pseudomonas areuginosa	49	62	62	41	49	59	55	55	66	57	77	78	710
Sta.aureus(MRSA)	102	119	130	96	128	131	104	95	81	83	118	103	1290
Sta.aureus(MRSA以外)	30	37	29	20	29	35	16	25	31	41	34	24	351
Streptococcus A	1	2	4	3			1	1	2	1			15
Streptococcus B	21	28	22	19	11	21	10	22	5	6	21	15	201
PRSP/PISP	7	13	6	9	9	8	4	5	1	8	8	3	81
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	10	12	19	14	21	13	7	8	16	9	15	6	150
Anaerobes	1	5	2	2	2	5	1		2			4	24
Mycoplasma pneumoniae								1					1
合計	263	330	344	264	290	343	271	269	247	274	352	294	3541

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
E.coli	63	61	74	62	56	77	75	72	84	78	79	73	854
Enterobacter spp.	1	5	2	4	6	3	6	10	7	13	10	5	72
Klebsiella pneumoniae	18	10	9	10	14	10	17	20	14	19	17	14	172
Acinetobacter spp.	1			3	1	2	3	1	2	1	2		16
Pseudomonas areuginosa	18	13	14	16	21	31	31	30	38	46	38	27	323
Sta.aureus(MRSA)	16	14	22	22	11	15	17	18	13	20	16	17	201
Sta.aureus(MRSA以外)	10	6	2	9	7	3	2	5	3	10	5	3	65
Sta.(コアグラーゼ陰性）	25	18	20	27	16	23	29	20	38	18	25	24	283
Enterococcus spp.	50	45	42	44	49	44	54	35	43	49	62	38	555
Candida albicans	9	9	8	7	9	9	13	12	8	7	10	10	111
合計	211	181	193	204	190	217	247	223	250	261	264	211	2652

菌種･群･型	2004年												合計
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12
Neisseria gonorrhoeae	2	4	3		2	3	1	1	1	1		1	19
Streptococcus B	14	14	10	14	15	10	16	1	16	15	10	15	150
Chlamydia trachomatis	1	5	2	3	3	3	1	1	1	1	1	1	23
Ureaplasma													0
Candida albicans	33	30	30	25	22	33	28	24	37	36	28	22	348
Trichomonas vaginalis													0
合計	50	53	45	42	42	49	46	27	55	53	39	39	540