2001(H13)年４月より県内の６総合病院で検出された病原菌を検査材料別に報告してもらい、集計を行っている。
　糞便材料の検出数は一年を通じて横ばい状態であるが、検出総数が2007(H19)年は大幅に減少した。（2005年:640件→2006年:453件→2007年:326件）咽頭および鼻咽喉材料の検出数も減少した。（図16）
　糞便検出病原菌の構成をみると、EPECやETECなどの大腸菌が全体の６1%をしめた。Salmonella属は減少傾向にあるが（2005年:16件→2006年:11件→2007年:10件）、本年Salmonella属による集団食中毒が１件発生した。（図17）
　血液、喀痰・気管吸引液および下気道材料からはStaphylococcus aureus（MRSA）を含むStaphylococcus 属の分離率が高かった。（血液64.9%、喀痰・気管吸引液および下気道46.4%） 調査対象医療機関名
　松江赤十字病院、島根県立中央病院、公立雲南総合病院、浜田医療センター、益田赤十字病院、隠岐広域連合立隠岐病院

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli(EHEC/VTEC)								1		1		1	3
E.coli(ETEC)	1	1		1					1	1	2		7
E.coli(EIEC)
E.coli(EPEC)	6	9	7	9	12	10	7	8	6	3	7	14	98
E.coli(その他･不明)	7	7	4	4	8	19	8	11	8	4	5	5	90
Salmonella Typhi
Salmonella Paratyphi A
Salmonella　O4							1	1					2
Salmonella　O7		1				1	1	1					4
Salmonella　O8		1											1
Salmonella　O9				1						2			3
Salmonella　O9,46
Salmonella　O3,10
Salmonella　O1,3,19
Salmonella　O13
Salmonella　O18
Salmonella　上記以外の群
Salmonella　群不明
Listeria monocytogenes				1									1
Yersinia entercolitica					1								1
Yersinia pseudotuberclosis
V.choleraeO1:Eltor, Ogawa,CT(+)
V.choleraeO1:Eltor, Ogawa,CT(-)
V.choleraeO1:Eltor, Inaba,CT(+)
V.choleraeO1:Eltor, Inaba,CT(-)
V.choleraeO139,CT(+)
V.choleraeO139,CT(-)
V.choleraeO1&O139以外									1				1
Vibrio parahaemolyticus		1											1
Vibrio fluvialis
Vibrio mimicus
Aeromonas hydrophila							1			1			2
Aeromonas sobria
Aeromonas hydrophila/sobria種別せず								1					1
Plesiomonas shigelloides
Campylobacter jejuni
Campylobacter coli
Campylobacter jejuni/coli種別せず				1	4	1	4	3	2	1	1	3	20
Sta.aureus(MRSA)	5	7	4	7	6	4	1	8	6	8	8	5	69
Sta.aureus(MRSA以外)				2	2	1	2	1	5	2	1	3	19
Clostridium perfringens												1	1
Clostridium botulinum E
Clostridium botulinum E以外
Bacillus cereus			1										1
Shigella dysenteriae 型( )
Shigella flexneri 型( )											1		1
Shigella boydii 型( )
Shigella sonni
Shigella 群不明
Entamoeba histolytica
Cryptosporidium
Giardia lamblia
合計	19	27	16	26	33	36	25	35	29	23	25	32	326

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli	4	1		1	3	3	1	2	5	1	2	3	26
Klebsiella pneumoniae	1					1			2	1	2	3	10
Haemophilus influenzae				1				2					3
Neisseria meningitidis
Pseudomonas areuginosa	2		1		2	1	1		3	1	1	7	19
Mycobacterium spp.
Sta.aureus(MRSA)	3	8	5	1	1	5	2	2	4	3			34
Sta.aureus(MRSA以外)	3	2	9	1	1		4	3	5	3	3	2	36
Sta.(コアグラーゼ陰性）			2	2	1	2	2		1	2	3		15
PRSP/PISP		1				1							2
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)							2						2
Anaerobes	2	3	2	3	2	2	1	3	5	1	5	5	34
Mycoplasma pneumoniae
合計	15	15	19	9	10	15	13	12	25	12	16	20	181

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli												1	1
Haemophilus influenzae	1											1	2
Neisseria meningitidis
Listeria monocytogenes
Sta.aureus(MRSA)
Sta.aureus(MRSA以外)	1												1
Streptococcus B												1	1
PRSP/PISP				1			1						2
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)									1				1
合計	2			1			1		1			3	8

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli	5	6	5	2	5	12	10	19	7	6	6	9	92
Salmonella Typhi
Salmonella Paratyphi A
Salmonella spp.
Haemophilus influenzae	1											1	2
Neisseria meningitidis
Listeria monocytogenes	1												1
Pseudomonas areuginosa			2		2		2		1	2	1	1	11
Sta.aureus(MRSA)	13	8	3	1	4	7	6	5	3	3	3	8	64
Sta.aureus(MRSA以外)	6	5	2	1	1	5	3	7	2	6	4	4	46
Sta.(コアグラーゼ陰性）	6	14	17	8	10	9	18	17	14	10	12	17	152
Streptococcus B	8	1		3						1			13
PRSP/PISP				1									1
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	1	1	2					1	1		1		7
Anaerobes	2		1	1		1	1	1		4	2	2	15
Plasmodium spp.
合計	43	35	32	17	22	34	40	50	28	32	29	42	404

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
Bordetella pertussis
Haemophilus influenzae	56	41	57	49	51	60	25	32	44	44	49	66	574
Neisseria meningitidis
Streptococcus A	28	37	4	5	5	5	3	6	3	2	4	5	107
PRSP/PISP	15	7	13	11	10	6	14	5	5	8	15	26	135
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	7	5	7	11	10	8	5	2	3	8	4	8	78
Corynebacterium diphtheriae
合計	106	90	81	76	76	79	47	45	55	62	72	105	894

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
Mycobacterium tuberculosis	2			4	2		1		1	1	3	2	16
Mycobacterium avium-intracellulare complex	2	2		1	1	3	3	2	5		2		21
Klebsiella pneumoniae	33	30	30	24	32	24	24	41	30	39	41	19	367
Haemophilus influenzae	17	16	26	17	14	16	15	20	12	20	24	21	218
Legionella pneumophila			6					1		4			11
Pseudomonas areuginosa	25	39	28	46	33	37	36	29	26	53	42	40	434
Sta.aureus(MRSA)	77	86	92	91	59	80	77	89	56	84	96	79	966
Sta.aureus(MRSA以外)	26	21	31	37	22	25	12	17	22	26	28	25	292
Streptococcus A					1								1
Streptococcus B	7	8	16	14	16	14	10	8	11	18	20	25	167
PRSP/PISP	13	8	14	13	5	14	2	3	5	4	11	9	101
Streptococcus pneumoniae(PRSP/PISP以外)	20	23	16	7	4	7	7	3	3	7	15	3	115
Anaerobes
Mycoplasma pneumoniae
合計	222	233	259	254	189	220	187	213	171	256	282	223	2709

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
E.coli	53	69	66	60	72	93	83	77	79	69	67	93	881
Enterobacter spp.	10	7	7	7	16	8	7	13	28	12	22	23	160
Klebsiella pneumoniae	7	8	16	10	16	21	13	18	15	23	19	16	182
Acinetobacter spp.	2				2	1	2	1	3			2	13
Pseudomonas areuginosa	30	24	33	17	14	25	23	25	34	28	22	30	305
Sta.aureus(MRSA)	8	13	12	21	19	16	20	24	19	11	12	17	192
Sta.aureus(MRSA以外)	1	5	3	1	3	2	7	5	8	4	4	7	50
Sta.(コアグラーゼ陰性）	18	11	16	12	14	18	10	15	13	19	7	20	173
Enterococcus spp.	34	29	41	30	33	41	47	38	36	43	38	47	457
Candida albicans	8	15	12	13	10	8	9	6	5	6	8	17	117
合計	171	181	206	171	199	233	221	222	240	215	199	272	2530

菌種･群･型	2007年
	1月	2月	3月	4月	5月	6月	7月	8月	9月	10月	11月	12月	合計
Neisseria gonorrhoeae			1		4			1			2		8
Streptococcus B	18	13	24	15	27	20	18	22	26	19	18	8	228
Chlamydia trachomatis	1				1	1	1	3	1	1	1	1	11
Ureaplasma
Candida albicans	41	32	30	26	32	26	46	30	29	47	34	33	406
Trichomonas vaginalis
合計	60	45	55	41	64	47	65	56	56	67	55	42	653