2005/2006年シーズンのインフルエンザの報告数は6,667件であり中規模の流行であった。2005(H17)年第52週に定点当り1.0人を越え流行シーズンに入り、2006(H18)年第2週には定点当たり10人を越え急速に流行が拡大し、ピークとなったのは1月末の第4週であった。第5週以降は患者数が減少し、3月末の第13週には定点当り1.0人以下にまで減少し終息したかに見えたが、散発的な患者報告が引き続きあり、5月に入った第18週に再び報告数が増加した。定点当りの報告数が1.0人以上になることは無かったが、初夏の小流行は5月下旬の第21週にピークとなり、最終的に報告が無くなり終息したのは6月末であった。
分離されたウイルスは、シーズン前半の1月から3月までの流行ではＡ香港型がほとんどを占め、散発的にＡソ連型が分離された。シーズン後半になりＢ型ウイルスが分離され、5月から6月の流行はＢ型によるもであった。
医療圏域別の年間の定点あたり患者数が多かったのは、大田圏域(239.0人)、浜田圏域(188.8人)、出雲圏域（186.2人）であった。5月から6月にかけての小流行で報告の多かったのは、雲南圏域(7.3人)、松江圏域(3.3人)、浜田圏域(3.0人)であり、雲南圏域と、浜田圏域では学級閉鎖の措置をとった学校があった。
年齢別では、シーズン前半の大きな流行は全年齢でみられたが、5月から6月の小流行では10〜19歳の比較的高い年齢層の報告が54％と多かった。
インフルエンザ報告グラフ
| 平均報告数 | 2001/02年 | 2002/03年 | 2003/04年 | 2004/05年 | 2005/06年 | (2006/07年) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 6,559 | 2,372 | 9,951 | 4,821 | 8,983 | 6,667 | 4 |